技术标签: 计算机视觉 图像处理 深度学习 pytorch 神经网络 脑部肿瘤分割
写在前面,作为BraTS2019分割挑战赛的第一名,其内容比较新颖,目前来看,是脑肿瘤分割方法在nnUnet出来前的集大成者,能看到多阶段,深度监督等思想的体现,同样本文是一个workshop,写作上更加直接
介绍损失函数
骰子相似系数(DSC)衡量预测地图和地面事实之间的重叠程度。DSC按公式计算。1,其中S是网络的输出,R是地面真值标签,|·|表示区域的体积。
D S C = 2 ∣ S ∩ R ∣ ∣ S ∣ + ∣ R ∣ \mathrm{DSC}=\frac{2|S \cap R|}{|S|+|R|} DSC=∣S∣+∣R∣2∣S∩R∣
其中soft dice 的公式如下:【分母变成平方和了】
L dice = 2 ∗ ∑ S ∗ R ∑ S 2 + ∑ R 2 + ϵ \mathbf{L}_{\text {dice }}=\frac{2 * \sum S * R}{\sum S^{2}+\sum R^{2}+\epsilon} Ldice =∑S2+∑R2+ϵ2∗∑S∗R
我们不学习标签(例如增强肿瘤、水肿、坏死和非增强),而是直接用骰子损失优化三个重叠区域(整个肿瘤、肿瘤核心和增强肿瘤),然后简单地将每个区域的骰子损失函数相加。我们还将每个阶段的损失相加,得出最终的损失。
第一阶段结构表【TransBTS的CNN结构就类似此结构,但是他的结果不可复现】
第二阶段结构表
主要讲一些实现的细节,比如什么框架,优化器,学习率变化情况等
我们的网络实现基于PyTorch 1.1.0。训练迭代的最大次数被设置为具有5个线性预热epoch的405个epoch。
我们使用ADAM优化器来更新网络的权重,最初的批大小为1,初始学习率为α₀=1e-4,并将其衰减如下:
α = α 0 × ( 1 − e N e ) 0.9 \alpha=\alpha_{0} \times\left(1-\frac{e}{N_{e}}\right)^{0.9} α=α0×(1−Nee)0.9
其中,e是epoch计数器,而分母ne是epoch。我们使用1e−5的L2权重衰减进行正则化。
训练在具有12 GB内存的NVIDIA Titan V图形处理器上执行。然而,在我们的实验中,我们的方法需要略多于12 GB的内存。我们利用PyTorch的梯度检查点来减少内存消耗。【checkpoint技术?】
文章浏览阅读645次。这个肯定是末尾的IDAT了,因为IDAT必须要满了才会开始一下个IDAT,这个明显就是末尾的IDAT了。,对应下面的create_head()代码。,对应下面的create_tail()代码。不要考虑爆破,我已经试了一下,太多情况了。题目来源:UNCTF。_攻防世界困难模式攻略图文
文章浏览阅读2.9k次,点赞3次,收藏10次。偶尔会用到,记录、分享。1. 数据库导出1.1 切换到dmdba用户su - dmdba1.2 进入达梦数据库安装路径的bin目录,执行导库操作 导出语句:./dexp cwy_init/[email protected]:5236 file=cwy_init.dmp log=cwy_init_exp.log 注释: cwy_init/init_123..._达梦数据库导入导出
文章浏览阅读1.9k次。1. 在官网上下载KindEditor文件,可以删掉不需要要到的jsp,asp,asp.net和php文件夹。接着把文件夹放到项目文件目录下。2. 修改html文件,在页面引入js文件:<script type="text/javascript" src="./kindeditor/kindeditor-all.js"></script><script type="text/javascript" src="./kindeditor/lang/zh-CN.js"_kindeditor.js
文章浏览阅读2.3k次,点赞6次,收藏14次。SPI的详情简介不必赘述。假设我们通过SPI发送0xAA,我们的数据线就会变为10101010,通过修改不同的内容,即可修改SPI中0和1的持续时间。比如0xF0即为前半周期为高电平,后半周期为低电平的状态。在SPI的通信模式中,CPHA配置会影响该实验,下图展示了不同采样位置的SPI时序图[1]。CPOL = 0,CPHA = 1:CLK空闲状态 = 低电平,数据在下降沿采样,并在上升沿移出CPOL = 0,CPHA = 0:CLK空闲状态 = 低电平,数据在上升沿采样,并在下降沿移出。_stm32g431cbu6
文章浏览阅读1.2k次,点赞2次,收藏8次。数据链路层习题自测问题1.数据链路(即逻辑链路)与链路(即物理链路)有何区别?“电路接通了”与”数据链路接通了”的区别何在?2.数据链路层中的链路控制包括哪些功能?试讨论数据链路层做成可靠的链路层有哪些优点和缺点。3.网络适配器的作用是什么?网络适配器工作在哪一层?4.数据链路层的三个基本问题(帧定界、透明传输和差错检测)为什么都必须加以解决?5.如果在数据链路层不进行帧定界,会发生什么问题?6.PPP协议的主要特点是什么?为什么PPP不使用帧的编号?PPP适用于什么情况?为什么PPP协议不_接收方收到链路层数据后,使用crc检验后,余数为0,说明链路层的传输时可靠传输
文章浏览阅读587次。软件测试工程师移民加拿大 无证移民,未受过软件工程师的教育(第1部分) (Undocumented Immigrant With No Education to Software Engineer(Part 1))Before I start, I want you to please bear with me on the way I write, I have very little gen...
文章浏览阅读304次。Thinkpad X250笔记本电脑,装的是FreeBSD,进入BIOS修改虚拟化配置(其后可能是误设置了安全开机),保存退出后系统无法启动,显示:secure boot failed ,把自己惊出一身冷汗,因为这台笔记本刚好还没开始做备份.....根据错误提示,到bios里面去找相关配置,在Security里面找到了Secure Boot选项,发现果然被设置为Enabled,将其修改为Disabled ,再开机,终于正常启动了。_安装完系统提示secureboot failure
文章浏览阅读10w+次,点赞93次,收藏352次。1、用strtok函数进行字符串分割原型: char *strtok(char *str, const char *delim);功能:分解字符串为一组字符串。参数说明:str为要分解的字符串,delim为分隔符字符串。返回值:从str开头开始的一个个被分割的串。当没有被分割的串时则返回NULL。其它:strtok函数线程不安全,可以使用strtok_r替代。示例://借助strtok实现split#include <string.h>#include <stdio.h&_c++ 字符串分割
文章浏览阅读2.3k次。1 .高斯日记 大数学家高斯有个好习惯:无论如何都要记日记。他的日记有个与众不同的地方,他从不注明年月日,而是用一个整数代替,比如:4210后来人们知道,那个整数就是日期,它表示那一天是高斯出生后的第几天。这或许也是个好习惯,它时时刻刻提醒着主人:日子又过去一天,还有多少时光可以用于浪费呢?高斯出生于:1777年4月30日。在高斯发现的一个重要定理的日记_2013年第四届c a组蓝桥杯省赛真题解答
文章浏览阅读851次,点赞17次,收藏22次。摘要:本文利用供需算法对核极限学习机(KELM)进行优化,并用于分类。
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文章浏览阅读257次。本文将为初学者提供Python学习的详细指南,从Python的历史、基础语法和数据类型到面向对象编程、模块和库的使用。通过本文,您将能够掌握Python编程的核心概念,为今后的编程学习和实践打下坚实基础。_python人工智能开发从入门到精通pdf